在多個物種上的研究表明，DNA指紋圖中的帶是獨立遺傳的，1個DNA探針實際上能同時檢測基因組中數十個位點的變異性。同時，在1個基因組中，用不同探針獲得的DNA指紋，在很大程度上是不一樣的用幾個不同的探針所獲得的信息可以累加。
DNA指紋圖譜的譜帶包含的多態信息量很豐富，遵循孟德爾遺傳規律，能共顯性地穩定遺傳給后代，雖然后代和雙親本間的圖譜不一樣，但后代的每1條都可以在雙親之一的圖中找到。在家畜親子鑒定中，主要根據后代某些遺傳位點上的等位基因，能否在可能的雙親中找到，采用排除原理進行鑒定，有就是，后代DNA指紋中的多有帶紋必定來自生物學意義的父親或母親，如果后代DNA指紋有1條紋在待定的父親或母親的DNA指紋中不存在，那么至少可以確定其中一方不是該后代的親本，照此下去，考察所有待定親本的DNA指紋，除了生物學意義的父親或母親以外，其余的都降被排除，因此剩下的即被認定為“真正”的父母。分析DNA指紋在牛的雙親鑒別的幾種情況，認為DNA指紋鑒定雙親比傳統的血型和生化多態性鑒定具有更大的優越性，DNA指紋技術是家畜親子鑒定的最有效工具，在當今技術背景下，應該是最為可靠、先進的技術手段之一。
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